Linux服务器Cache占用过多内存导致系统内存不足问题的排查解决
问题描述
Linux服务器内存使用量超过阈值,触发报警。
问题排查
首先,通过free命令观察系统的内存使用情况,显示如下:
total used <span style="color: #0000ff;">free</span> shared buffers cached Mem: <span style="color: #800080;">24675796</span> <span style="color: #800080;">24587144</span> <span style="color: #800080;">88652</span> <span style="color: #800080;">0</span> <span style="color: #800080;">357012</span> <span style="color: #800080;">1612488</span> -/+ buffers/cache: <span style="color: #800080;">22617644</span> <span style="color: #800080;">2058152</span> Swap: <span style="color: #800080;">2096472</span> <span style="color: #800080;">108224</span> <span style="color: #800080;">1988248</span>
其中,可以看出内存总量为24675796KB,已使用22617644KB,只剩余2058152KB。
然后,接着通过top命令,shift + M按内存排序后,观察系统中使用内存最大的进程情况,发现只占用了18GB内存,其他进程均很小,可忽略。
因此,还有将近4GB内存(22617644KB-18GB,约4GB)用到什么地方了呢?
进一步,通过cat /proc/meminfo发现,其中有将近4GB(3688732 KB)的Slab内存:
...... Mapped: <span style="color: #800080;">25212</span> kB Slab: <span style="color: #800080;">3688732</span> kB PageTables: <span style="color: #800080;">43524</span> kB ......
Slab是用于存放内核数据结构缓存,再通过slabtop命令查看这部分内存的使用情况:
OBJS ACTIVE USE OBJ SIZE SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME <span style="color: #800080;">13926348</span> <span style="color: #800080;">13926348</span> <span style="color: #800080;">100</span>% <span style="color: #800080;">0</span>.21K <span style="color: #800080;">773686</span> <span style="color: #800080;">18</span> 3494744K dentry_cache <span style="color: #800080;">334040</span> <span style="color: #800080;">262056</span> <span style="color: #800080;">78</span>% <span style="color: #800080;">0</span>.09K <span style="color: #800080;">8351</span> <span style="color: #800080;">40</span> 33404K buffer_head <span style="color: #800080;">151040</span> <span style="color: #800080;">150537</span> <span style="color: #800080;">99</span>% <span style="color: #800080;">0</span>.74K <span style="color: #800080;">30208</span> <span style="color: #800080;">5</span> 120832K ext3_inode_cache
发现其中大部分(大约3.5GB)都是用于了dentry_cache。
问题解决
1. 修改/proc/sys/vm/drop_caches,释放Slab占用的cache内存空间(参考drop_caches的官方文档):
Writing to this will cause the kernel to drop clean caches, dentries and inodes from memory, causing that memory to become <span style="color: #0000ff;">free</span>. To <span style="color: #0000ff;">free</span> pagecache: * <span style="color: #0000ff;">echo</span> <span style="color: #800080;">1</span> > /proc/sys/vm/drop_caches To <span style="color: #0000ff;">free</span> dentries and inodes: * <span style="color: #0000ff;">echo</span> <span style="color: #800080;">2</span> > /proc/sys/vm/drop_caches To <span style="color: #0000ff;">free</span> pagecache, dentries and inodes: * <span style="color: #0000ff;">echo</span> <span style="color: #800080;">3</span> > /proc/sys/vm/drop_caches As this is a non-destructive operation, and dirty objects are notfreeable, the user should run <span style="color: #800000;">"</span><span style="color: #800000;">sync</span><span style="color: #800000;">"</span> first <span style="color: #0000ff;">in</span> order to <span style="color: #0000ff;">make</span> sure allcached objects are freed. This tunable was added <span style="color: #0000ff;">in</span> <span style="color: #800080;">2.6</span>.<span style="color: #800080;">16</span>.
2. 方法1需要用户具有root权限,如果不是root,但有sudo权限,可以通过sysctl命令进行设置:
$<span style="color: #0000ff;">sync</span> $<span style="color: #0000ff;">sudo</span> sysctl -<span style="color: #0000ff;">w</span> vm.drop_caches=<span style="color: #800080;">3</span> $<span style="color: #0000ff;">sudo</span> sysctl -<span style="color: #0000ff;">w</span> vm.drop_caches=<span style="color: #800080;">0 #recovery drop_caches</span>
操作后可以通过sudo sysctl -a | grep drop_caches查看是否生效。
3. 修改/proc/sys/vm/vfs_cache_pressure,调整清理inode/dentry caches的优先级(默认为100),LinuxInsight中有相关的解释:
At the default value of vfs_cache_pressure = 100 the kernel will attempt to reclaim dentries and inodes at a “fair” rate with respect to pagecache and swapcache reclaim. Decreasing vfs_cache_pressure causes the kernel to prefer to retain dentry and inode caches. Increasing vfs_cache_pressure beyond 100 causes the kernel to prefer to reclaim dentries and inodes.
具体的设置方法,可以参考方法1或者方法2均可。
参考资料
https://www.kernel.org/doc/Documentation/sysctl/vm.txt
http://major.io/2008/12/03/reducing-inode-and-dentry-caches-to-keep-oom-killer-at-bay/
http://linux-mm.org/Drop_Caches
更深层次的原因
前一篇文章里排查到Linux系统中有大量的dentry_cache占用内存,为什么会有如此多的dentry_cache呢?
1. 首先,弄清楚dentry_cache的概念及作用:目录项高速缓存,是Linux为了提高目录项对象的处理效率而设计的;它记录了目录项到inode的映射关系。因此,当应用程序发起stat系统调用时,就会创建对应的dentry_cache项(更进一步,如果每次stat的文件都是不存在的文件,那么总是会有大量新的dentry_cache项被创建)。
2. 当前服务器是storm集群的节点,首先想到了storm相关的工作进程,strace一下storm的worker进程发现其中有非常频繁的stat系统调用发生,而且stat的文件总是新的文件名:
<span style="color: #0000ff;">sudo</span> strace -fp <span style="color: #800080;"><pid></span> -e trace=<span style="color: #0000ff;">stat</span>
3. 进一步观察到storm的worker进程会在本地目录下频繁的创建、打开、关闭、删除心跳文件,每秒钟一个新的文件名:
<span style="color: #0000ff;">sudo</span> strace -fp <span style="color: #800080;"><pid> </span>-e trace=open,<span style="color: #0000ff;">stat,close,unlink</span>
以上就是系统中为何有如此多的dentry_cache的原因所在。
一个奇怪的现象
通过观察/proc/meminfo发现,slab内存分为两部分:
SReclaimable <span style="color: #008000;">//</span><span style="color: #008000;"> 可回收的slab</span> SUnreclaim <span style="color: #008000;">//</span><span style="color: #008000;"> 不可回收的slab</span>
当时服务器的现状是:slab部分占用的内存,大部分显示的都是SReclaimable,也就是说可以被回收的。
但是通过slabtop观察到slab内存中最主要的部分(dentry_cache)的OBJS几乎都是ACTIVE的,显示100%处于被使用状态。
OBJS ACTIVE USE OBJ SIZE SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME <span style="color: #800080;">13926348</span> <span style="color: #800080;">13926348</span> <span style="color: #ff0000;"><strong>100%</strong></span> <span style="color: #800080;">0</span>.21K <span style="color: #800080;">773686</span> <span style="color: #800080;">18</span> 3494744K dentry_cache <span style="color: #800080;">334040</span> <span style="color: #800080;">262056</span> <span style="color: #800080;">78</span>% <span style="color: #800080;">0</span>.09K <span style="color: #800080;">8351</span> <span style="color: #800080;">40</span> 33404K buffer_head <span style="color: #800080;">151040</span> <span style="color: #800080;">150537</span> <span style="color: #800080;">99</span>% <span style="color: #800080;">0</span>.74K <span style="color: #800080;">30208</span> <span style="color: #800080;">5</span> 120832K ext3_inode_cache
为什么显示可回收的,但是又处于ACTIVE状态呢?求Linux内核达人看到后热心解释下:(
会不会由于是ACTIVE状态,导致dcache没有被自动回收释放掉呢?
让系统自动回收dcache
上一小节,我们已经提到,服务器上大部分的slab内存是SReclaimable可回收状态的,那么,我们能不能交给操作系统让他在某个时机自动触发回收操作呢?答案是肯定的。
查了一些关于Linux dcache的相关资料,发现操作系统会在到了内存临界阈值后,触发kswapd内核进程工作才进行释放,这个阈值的计算方法如下:
1. 首先,grep low /proc/zoneinfo,得到如下结果:
low <span style="color: #800080;">1</span> low <span style="color: #800080;">380</span> low <span style="color: #800080;">12067</span>
2. 将以上3列加起来,乘以4KB,就是这个阈值,通过这个方法计算后发现当前服务器的回收阈值只有48MB,因此很难看到这一现象,实际中可能等不到回收,操作系统就会hang住没响应了。
3. 可以通过以下方法调大这个阈值:将vm.extra_free_kbytes设置为vm.min_free_kbytes和一样大,则/proc/zoneinfo中对应的low阈值就会增大一倍,同时high阈值也会随之增长,以此类推。
$ <span style="color: #0000ff;">sudo</span> sysctl -a | <span style="color: #0000ff;">grep</span> free_kbytes vm.min_free_kbytes = <span style="color: #800080;">39847</span> vm.extra_free_kbytes = <span style="color: #800080;">0 $ sudo sysctl -w vm.extra_free_kbytes=836787 ######1GB </span>
4. 举个例子,当low阈值被设置为1GB的时候,当系统free的内存小于1GB时,观察到kswapd进程开始工作(进程状态从Sleeping变为Running),同时dcache开始被系统回收,直到系统free的内存介于low阈值和high阈值之间,停止回收。